228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2536 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  100 
 
 		 136 aa  276  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  50.41 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  55.28 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  47.54 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  45.9 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  47.11 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  45.9 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  49.5 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  47.01 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  42.98 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  46.46 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  46.28 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  44.63 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  45.9 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  46.28 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  44.26 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  49.59 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  50.51 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  43.9 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  43.44 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 134 aa  106  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  42.5 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  43.44 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  45.9 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  53.33 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  40.83 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  33.83 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  44.17 
 
 		 388 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  50.54 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  44 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  38.17 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  43.65 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  49.04 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  49.04 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  45 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  47.06 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  43.08 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  39.39 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  43.7 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  53.57 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  58.82 
 
 		 582 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  40.52 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  40.65 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  41.46 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  45.86 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  48.31 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  53.09 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  39.26 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0665  cytidine deaminase  57.41 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0233201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  42.15 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  46.85 
 
 		 231 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  43.36 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 234 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  45.05 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>