More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2529 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
318 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  50.84 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  47.16 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  50.17 
 
 
288 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  46.86 
 
 
405 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  47.78 
 
 
301 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  45.87 
 
 
426 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  42.04 
 
 
408 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  43.4 
 
 
399 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.05 
 
 
316 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 
358 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
329 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  36.25 
 
 
330 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 
330 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.55 
 
 
311 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 
337 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.59 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.7 
 
 
362 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
350 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
337 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  35.58 
 
 
329 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
350 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
350 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 
359 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 
342 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  36.39 
 
 
362 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.75 
 
 
351 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 
314 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.97 
 
 
310 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.08 
 
 
313 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  30.79 
 
 
389 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
321 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.67 
 
 
318 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  29.17 
 
 
382 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  29.17 
 
 
382 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.68 
 
 
384 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35.25 
 
 
351 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  29.7 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.83 
 
 
344 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  27.46 
 
 
444 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 
394 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  36.22 
 
 
211 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.52 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.81 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.17 
 
 
382 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.54 
 
 
355 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  31.54 
 
 
538 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
544 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
517 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
532 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
517 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
517 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 
531 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.25 
 
 
525 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  30.68 
 
 
345 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 
557 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  26.63 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.04 
 
 
421 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  31.67 
 
 
308 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
418 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 
243 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
535 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
535 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.36 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.8 
 
 
271 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.46 
 
 
398 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.28 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.63 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  29.58 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  29.58 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  33.04 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
320 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
320 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  30.08 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  24.79 
 
 
375 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.9 
 
 
385 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  25.94 
 
 
388 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25.07 
 
 
375 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
288 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  31.42 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.87 
 
 
324 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>