More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2523 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  36.53 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  41.07 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  41.84 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  37.91 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  38.31 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  44.44 
 
 		 112 aa  84  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  42.06 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  34.46 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  39.05 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.78 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 104 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.96 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 114 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  37.89 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  33.91 
 
 		 423 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.36 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  28.87 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  33.09 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  34.43 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  34.43 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  33.09 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.52 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>