More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2515 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  981    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  64.33 
 
 		 451 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  56.14 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  47.71 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 433 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  44.87 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 		 437 aa  349  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 513 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 372 aa  97.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.12 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  32.08 
 
 		 301 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.65 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  31.98 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.26 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.84 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  30.88 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.13 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 342 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.13 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 342 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  26.6 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 873 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.28 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.97 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.82 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.13 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.92 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.63 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  29.88 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  28.79 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.32 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.47 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.58 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.89 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  26.64 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.24 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  32.86 
 
 		 338 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.07 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.5 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.81 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.35 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  31.06 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.19 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30.24 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1273  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.390011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>