108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2488 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  55.31 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  52.81 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  53.63 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  50.84 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  47.31 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  44.07 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  38.98 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  41.57 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  40.12 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  36.99 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  39.08 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  37.43 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  36.88 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  36.88 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  36.88 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  36.25 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  36.25 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  34.5 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  34.64 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  36.26 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  35.67 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  34.57 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  37.28 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  34.48 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  36.84 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.89 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  34.36 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  31.79 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  43.36 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  40.35 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  35.81 
 
 		 148 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  43.64 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.33 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.54 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  37.6 
 
 		 144 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  36.84 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  29.88 
 
 		 163 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  40.52 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  38.14 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  39.47 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  39.32 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.48 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  38.79 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  37.39 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  37.31 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  35.34 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  35.65 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  33.62 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.38 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  36.28 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  35.05 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  40 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  40 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  35 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  33.62 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  35 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  27.47 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  33.9 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.78 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  34 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  36.46 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  31.9 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  31.9 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  31.9 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  27.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  36.63 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  32.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  29.66 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  36.63 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  31.91 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  22.52 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  27.82 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  38.55 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  35.64 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  29.09 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  30.08 
 
 		 129 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  33.66 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  23.37 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  28.28 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  24.73 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  33.66 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  28.87 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  27.08 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  27 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  27.08 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  28.95 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  28.12 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  28.12 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  28.12 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1311  OsmC family protein  26.27 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.474766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  26.62 
 
 		 164 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  26.45 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  25.53 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  26 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  22.8 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>