231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2456 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
438 aa  867    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  50.35 
 
 
455 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  48.37 
 
 
455 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  47.91 
 
 
436 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  49.06 
 
 
472 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  52.25 
 
 
445 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  47.91 
 
 
451 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  46.26 
 
 
438 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 
444 aa  359  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  46.51 
 
 
450 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  44.88 
 
 
464 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  46.44 
 
 
402 aa  336  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  42.99 
 
 
452 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  41.38 
 
 
435 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.33 
 
 
409 aa  316  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  42.83 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  43.13 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.22 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  43.26 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.96 
 
 
390 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  43.16 
 
 
391 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  43.06 
 
 
453 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.29 
 
 
391 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.59 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.13 
 
 
391 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  44.26 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  41.49 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.71 
 
 
389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.71 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.71 
 
 
389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.44 
 
 
391 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.47 
 
 
389 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.62 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.8 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.15 
 
 
391 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.63 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  40.56 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  41.96 
 
 
451 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.76 
 
 
397 aa  302  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  42.38 
 
 
444 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 
389 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  42.23 
 
 
457 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.22 
 
 
391 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.66 
 
 
399 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 
389 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  43.12 
 
 
383 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.81 
 
 
430 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  40.37 
 
 
406 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.29 
 
 
395 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.69 
 
 
391 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  43.53 
 
 
389 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.59 
 
 
397 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.34 
 
 
395 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.44 
 
 
425 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  43.72 
 
 
393 aa  293  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  44.27 
 
 
392 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  41.77 
 
 
455 aa  292  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.99 
 
 
399 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  42.96 
 
 
423 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  43.85 
 
 
408 aa  292  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.65 
 
 
397 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.52 
 
 
382 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  42.68 
 
 
381 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.16 
 
 
421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.78 
 
 
397 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  39.03 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.13 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  38.89 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  41.96 
 
 
475 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  44.24 
 
 
413 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  40.56 
 
 
386 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.67 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  45.18 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.1 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  39.76 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.31 
 
 
398 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.81 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  43.91 
 
 
388 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  41.75 
 
 
398 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  42.96 
 
 
399 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  39.12 
 
 
449 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.72 
 
 
424 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  40.37 
 
 
446 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  39.05 
 
 
439 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  41.51 
 
 
624 aa  279  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>