More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2424 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  100 
 
 
278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 
285 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  43.6 
 
 
276 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  42.19 
 
 
275 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  40 
 
 
274 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.3 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  40.8 
 
 
295 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  33.58 
 
 
290 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  33.7 
 
 
306 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  35.98 
 
 
281 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  37.3 
 
 
307 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  34.41 
 
 
287 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  36.9 
 
 
307 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  34 
 
 
271 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  33.06 
 
 
265 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  32.66 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  32.86 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  37.38 
 
 
266 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  37.45 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  37.45 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  37.45 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  34.24 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  29.93 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  36.16 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.11 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  33.47 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  31.69 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  34.82 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  31.51 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  29.07 
 
 
332 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  34.73 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  34.57 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  32.46 
 
 
299 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.18 
 
 
294 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  28.16 
 
 
324 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  30.86 
 
 
293 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30.96 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.96 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  30.96 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  30.96 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  30.96 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  30.96 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  30.96 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  30.96 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  29.93 
 
 
315 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.6 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  32.96 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  29.79 
 
 
294 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  32.22 
 
 
298 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  31.16 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  28.32 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  34.19 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  38.14 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 
301 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  29.8 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32 
 
 
297 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  33.05 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.16 
 
 
286 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  27.01 
 
 
266 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  28.41 
 
 
292 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  32.11 
 
 
279 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  30.68 
 
 
295 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  31.76 
 
 
307 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.86 
 
 
285 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  31.35 
 
 
307 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.95 
 
 
307 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  30.6 
 
 
296 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  31.35 
 
 
304 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  32.03 
 
 
279 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  27.57 
 
 
297 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  31.87 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  28.45 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.25 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.12 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  27.62 
 
 
304 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  25.73 
 
 
307 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  29.06 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.92 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.81 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  28.85 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  27.78 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.25 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  31.15 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  25.31 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  28.4 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>