More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2421 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  64.6 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  59.45 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  58.76 
 
 		 290 aa  358  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 292 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 292 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  54.98 
 
 		 292 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  51.02 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  53.11 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  48.47 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 291 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 		 290 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  51.81 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  51.65 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  51.81 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  51.81 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 292 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  50.55 
 
 		 291 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 297 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  48.81 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.63 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.26 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.26 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.52 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.52 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>