More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2360 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  44.03 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.02 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.19 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.19 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.1 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.84 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.07 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.29 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.86 
 
 		 363 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  36.51 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.18 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  41.07 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.29 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.1 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.36 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.62 
 
 		 396 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.23 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  35.54 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  37.17 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.52 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  33.88 
 
 		 386 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.52 
 
 		 314 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.71 
 
 		 360 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.3 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  35.48 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  35.48 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.7 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.43 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  34.92 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.33 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  35.25 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  37.1 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.77 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  34.62 
 
 		 352 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  32.23 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.09 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.36 
 
 		 318 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.09 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  36.89 
 
 		 316 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  31.4 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  29.75 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  34.35 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>