More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2340 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  100 
 
 		 330 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  41.18 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  41.69 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  39.14 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  39.87 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.91 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  37.46 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  36.79 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  34.11 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.25 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.29 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  34.31 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.58 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.97 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  36.56 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  34.39 
 
 		 303 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.99 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  36.25 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  34.2 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  36.39 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  36.81 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.13 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.1 
 
 		 256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.22 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  36.36 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  32.54 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  37.18 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  34.43 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  34.41 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  31.66 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  36.83 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.43 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 474 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.89 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  34.08 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.33 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  36.13 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.33 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  30.74 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.79 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  33.77 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.23 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  33.77 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  33.77 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.99 
 
 		 273 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  35.06 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.77 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  32.58 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  34.73 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.34 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  33.88 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1726  patatin  37.3 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0620011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  33.87 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.26 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.35 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  34.41 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  41.24 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  32.34 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.19 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  31.92 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.03 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  36.91 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.56 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  31.27 
 
 		 287 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  34.27 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  34.42 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.18 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.87 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.78 
 
 		 727 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  30.49 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.66 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  30.49 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.99 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  35.95 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.53 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  34.53 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  31.27 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  34.97 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  42.62 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.72 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  39.29 
 
 		 741 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.72 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.72 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  33.96 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.72 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>