More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2326 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 560 aa  1116    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  49.09 
 
 		 558 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  47.45 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  48.37 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  46.45 
 
 		 556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  44.38 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  39.9 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  41.04 
 
 		 574 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.83 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  37.67 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  37.67 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  37.5 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  37.33 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 579 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 579 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 572 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  40.71 
 
 		 565 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 579 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.71 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  40.24 
 
 		 601 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  37.22 
 
 		 578 aa  349  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  37.75 
 
 		 605 aa  349  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 		 558 aa  349  9e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 		 573 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  40.24 
 
 		 599 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  39.78 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  41.26 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  40.49 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  39.01 
 
 		 568 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  39.01 
 
 		 568 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 565 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.02 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 562 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.87 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 567 aa  330  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 558 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  34.7 
 
 		 555 aa  326  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  38.59 
 
 		 549 aa  326  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  34.7 
 
 		 555 aa  326  9e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.33 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.23 
 
 		 554 aa  324  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.3 
 
 		 556 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 589 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  38.92 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 555 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 552 aa  320  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 		 549 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.24 
 
 		 555 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.93 
 
 		 555 aa  320  6e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 587 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 549 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 549 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 549 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  38.82 
 
 		 576 aa  316  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  38.22 
 
 		 549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 565 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  39.36 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.35 
 
 		 562 aa  313  5.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  36.33 
 
 		 553 aa  312  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  33.45 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  36.51 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  36.33 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.03 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>