More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2283 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  100 
 
 
398 aa  793    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.38 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.67 
 
 
429 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.89 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  45.64 
 
 
404 aa  338  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.86 
 
 
410 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
412 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.75 
 
 
438 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  44.91 
 
 
404 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  44.78 
 
 
429 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.28 
 
 
404 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.53 
 
 
418 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 
418 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  45.68 
 
 
411 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 
406 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  46.35 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  42.82 
 
 
405 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  42.82 
 
 
410 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.71 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  43.22 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
415 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
404 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  45.57 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  45.48 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  42.36 
 
 
398 aa  299  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  44.94 
 
 
407 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.44 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  41.1 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  43.01 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.65 
 
 
432 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  40.15 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.96 
 
 
403 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.16 
 
 
429 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 
419 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  39.61 
 
 
400 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.68 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  40.3 
 
 
406 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
421 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 
419 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  36.91 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 
410 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  39.56 
 
 
380 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  37.4 
 
 
417 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  37.4 
 
 
417 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  37.4 
 
 
417 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.21 
 
 
325 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  41.21 
 
 
325 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  37.4 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
435 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  38.42 
 
 
419 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  46.78 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  46.4 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  41.59 
 
 
325 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.35 
 
 
325 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.01 
 
 
326 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  51.21 
 
 
357 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.93 
 
 
306 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.93 
 
 
306 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  49.09 
 
 
322 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  49.09 
 
 
322 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  49.09 
 
 
322 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  49.09 
 
 
322 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  49.09 
 
 
322 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.18 
 
 
322 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  40.25 
 
 
326 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  40.25 
 
 
326 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  40.25 
 
 
326 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 
400 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  48.33 
 
 
400 aa  203  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 
328 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  47.51 
 
 
322 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
322 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  43.87 
 
 
317 aa  203  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47.01 
 
 
298 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  42.35 
 
 
306 aa  202  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  41.67 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 
298 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  44.84 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  51.94 
 
 
215 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  46.83 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.19 
 
 
281 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.95 
 
 
275 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.02 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 
306 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  48.82 
 
 
236 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 
335 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  44.39 
 
 
327 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>