More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2235 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 479 aa  959    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  55.25 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  54.45 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  57.73 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  54.12 
 
 		 492 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  55.08 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  55.08 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  52.42 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 		 264 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 		 270 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 		 270 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 270 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 270 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 		 273 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 		 270 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 270 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 		 266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  48.82 
 
 		 270 aa  243  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 		 271 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.52 
 
 		 263 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 269 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 		 270 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 267 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  51.18 
 
 		 267 aa  237  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 279 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 		 264 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  47.41 
 
 		 265 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 		 266 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.83 
 
 		 264 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 		 266 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 		 268 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  48.62 
 
 		 265 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  48.81 
 
 		 264 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 		 284 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 		 272 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 268 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 		 267 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 260 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 273 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 		 269 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 		 268 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 		 270 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 		 270 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 285 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 268 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 262 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 		 270 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  42.11 
 
 		 270 aa  217  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.57 
 
 		 268 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 268 aa  217  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 288 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 268 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 288 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 288 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  43.23 
 
 		 274 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  43.23 
 
 		 274 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  43.23 
 
 		 274 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 269 aa  215  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  51.97 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  43.56 
 
 		 274 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  44.11 
 
 		 273 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 269 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  51.05 
 
 		 259 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 		 271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 285 aa  213  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  42.86 
 
 		 274 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  42.86 
 
 		 274 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  42.86 
 
 		 274 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  42.86 
 
 		 274 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 266 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  42.86 
 
 		 274 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 277 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 266 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 		 268 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 285 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 266 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 267 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 276 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 276 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  43.18 
 
 		 274 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 271 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 257 aa  208  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  51.57 
 
 		 264 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 266 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 		 286 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 266 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 266 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  46.59 
 
 		 271 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  44.7 
 
 		 270 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>