260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2227 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  42.02 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  43.62 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  42.11 
 
 
251 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  42.32 
 
 
249 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  42.32 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  40.33 
 
 
251 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  45.06 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  44.17 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  41.56 
 
 
241 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  43.9 
 
 
258 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  42.74 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  43.88 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  36.71 
 
 
246 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  38.4 
 
 
241 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  41.32 
 
 
249 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  37.13 
 
 
241 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  37.13 
 
 
241 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  45.15 
 
 
266 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  38.43 
 
 
249 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  32.57 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  36.99 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  36.99 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  36.99 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  37.4 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  36.59 
 
 
246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  40.16 
 
 
268 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.3 
 
 
247 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  35.8 
 
 
246 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  33.78 
 
 
220 aa  144  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  33.61 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  37.19 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  31.2 
 
 
254 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  32.57 
 
 
228 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  31.3 
 
 
240 aa  135  4e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.95 
 
 
249 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  30.83 
 
 
243 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  36.79 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  32.37 
 
 
254 aa  122  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  31.03 
 
 
233 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  32.16 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  29.51 
 
 
338 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  28.11 
 
 
222 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.68 
 
 
237 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  48.74 
 
 
438 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  25.44 
 
 
235 aa  101  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  24.48 
 
 
263 aa  100  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.73 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.73 
 
 
330 aa  98.6  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  32.64 
 
 
398 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  32.26 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  31.91 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  33.19 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  34.39 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.19 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.69 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  33.19 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  26.53 
 
 
217 aa  88.6  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.26 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  31.25 
 
 
252 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  30.93 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  25.56 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  31.33 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  30.47 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  31.91 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  29.61 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  23.5 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  30.67 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.49 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.49 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  22.01 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  23.08 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  27.32 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  28.74 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  22.58 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  23.26 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  28.34 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  31.17 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  34.01 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  25.22 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  29.19 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  31.43 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  32.89 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  30.84 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  30.84 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  32.62 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  30.84 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  31.54 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  31.54 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  23.15 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>