More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2012 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  51.27 
 
 		 210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  50.49 
 
 		 208 aa  211  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  50.25 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  46.57 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  48.04 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  48.04 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  49.49 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  45.59 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  45.15 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  46.41 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  45.1 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  45.54 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  47.87 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  44.78 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.55 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  46.5 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  41.18 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  45.69 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  42.64 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 		 221 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  41.84 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  42.64 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  42.71 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  40.69 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  40.61 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  43.65 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  40.31 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  43.65 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  39.59 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  44.16 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  39.59 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  43.15 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.36 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  39.59 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  39.59 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  39.09 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  39.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  39.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  39.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  39.59 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  40.89 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  40.89 
 
 		 237 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  40.89 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  40.82 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.59 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  41.33 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  40.39 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  41.62 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  41.71 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  40.61 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  42 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>