56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2006 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  100 
 
 
468 aa  961  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  53.03 
 
 
469 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  53.13 
 
 
480 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  44.77 
 
 
478 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  49.03 
 
 
432 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  47.1 
 
 
432 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  44.39 
 
 
458 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  44.68 
 
 
459 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  42.56 
 
 
453 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  44.55 
 
 
456 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  38.51 
 
 
536 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  42 
 
 
441 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  39.22 
 
 
519 aa  324  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  39.86 
 
 
436 aa  322  1e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  39.86 
 
 
436 aa  322  1e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  42.17 
 
 
434 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  38.06 
 
 
441 aa  315  1e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  40.28 
 
 
436 aa  314  2e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  39.9 
 
 
466 aa  314  2e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  39.9 
 
 
538 aa  314  2e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  39.66 
 
 
538 aa  312  7e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  38.1 
 
 
435 aa  312  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.07 
 
 
452 aa  308  2e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  38.7 
 
 
578 aa  306  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  37.8 
 
 
538 aa  305  1e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  38.69 
 
 
460 aa  303  3e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  39.9 
 
 
466 aa  303  4e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  40.39 
 
 
466 aa  303  4e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  38.69 
 
 
460 aa  303  5e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  38.69 
 
 
460 aa  303  5e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  38.81 
 
 
435 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  37.96 
 
 
460 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  37.96 
 
 
472 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  37.96 
 
 
466 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  37.96 
 
 
466 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  37.96 
 
 
466 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  38.59 
 
 
470 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  35.59 
 
 
440 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  37.47 
 
 
499 aa  285  2e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  39.56 
 
 
427 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.38 
 
 
438 aa  259  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.02 
 
 
437 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
561 aa  50.1  8e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  46.94 
 
 
575 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.47 
 
 
566 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  42.86 
 
 
574 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40 
 
 
571 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  44.9 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  48.89 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  48.89 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  51.11 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  46 
 
 
644 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  46.67 
 
 
367 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  52.5 
 
 
1141 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  29.46 
 
 
789 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.94 
 
 
553 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>