285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1979 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  970    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  45.29 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  44.8 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  43.41 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  42.79 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  49.15 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  44.66 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  39.22 
 
 		 442 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  41 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  36.09 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  35.73 
 
 		 452 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  35.25 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  33.63 
 
 		 487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  34.76 
 
 		 439 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  35 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 561 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  32.39 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  34.43 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  31.93 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  31.39 
 
 		 459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  43.5 
 
 		 286 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  35.34 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  32.16 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  28.49 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  31.88 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  31.41 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  31.35 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  34.49 
 
 		 295 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  35.32 
 
 		 337 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  36.72 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  36.33 
 
 		 411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 300 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  33.59 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  34.8 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  35.96 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  35.96 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  30.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  30.66 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  34.2 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  32.67 
 
 		 303 aa  133  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 405 aa  133  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 285 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  35.6 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  34.09 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  29.08 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  32.14 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  28.95 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 310 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  29.88 
 
 		 416 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  32.58 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 320 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  29.18 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  28.79 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 292 aa  124  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  28.12 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  35.08 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 294 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 294 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 294 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 437 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  31.67 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  34.68 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  30.16 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  33.71 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  30.48 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  30.86 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  30.48 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  33.61 
 
 		 303 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 443 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  30.74 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.77 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  32.68 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  30.59 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  31.11 
 
 		 290 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  31.06 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  31.06 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  31.06 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>