154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1977 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  60.22 
 
 		 269 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  63.4 
 
 		 271 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  64.81 
 
 		 270 aa  321  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  66.29 
 
 		 273 aa  318  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  61.99 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  59.02 
 
 		 269 aa  317  9e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  59.26 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  61.62 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  60.15 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  66.3 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  61.11 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  57.52 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  59.39 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  60.22 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  54.04 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  64.68 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  50.37 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  52.63 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  51 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  53.26 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  46.86 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  51.37 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  49.25 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  45.52 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  43.61 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  43.61 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  43.22 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  44.44 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  41.42 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  42.8 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  40.96 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  42.11 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  42.11 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  40.59 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  39.93 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  39.36 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  41.49 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  40.98 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  41 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  39.34 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  37.55 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  36.8 
 
 		 261 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  42.4 
 
 		 306 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  43.27 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  39.69 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  42.97 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  42.7 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  40.75 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  43.63 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  43.07 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  40.23 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  40.53 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  40.44 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  36.55 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  40.5 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.2 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  36.29 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  36.25 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  34.98 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  39.29 
 
 		 305 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  36.14 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  35.34 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  39.51 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  33.68 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  39.04 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  30.08 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  37.84 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  31.6 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  27.38 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  30.56 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  31.4 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  34.09 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  32 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.64 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  32.44 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  31.14 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.08 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.38 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  29.1 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  30 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  29.17 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  32.54 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>