More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1969 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  60.69 
 
 		 697 aa  883    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  46.13 
 
 		 692 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  43.81 
 
 		 691 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.04 
 
 		 691 aa  641    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  47.95 
 
 		 688 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  46.95 
 
 		 679 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  46.94 
 
 		 685 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  59.39 
 
 		 701 aa  863    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  44.53 
 
 		 689 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  48.6 
 
 		 688 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  46.57 
 
 		 692 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  100 
 
 		 692 aa  1416    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.63 
 
 		 689 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.63 
 
 		 689 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  59.97 
 
 		 701 aa  860    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  46.27 
 
 		 692 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  61.14 
 
 		 697 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  47.88 
 
 		 686 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  49.56 
 
 		 686 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  49.21 
 
 		 680 aa  661    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  45.44 
 
 		 692 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.41 
 
 		 692 aa  695    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  44.93 
 
 		 692 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  47.66 
 
 		 695 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  45.41 
 
 		 697 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  45.03 
 
 		 692 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  57.66 
 
 		 694 aa  848    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  44.85 
 
 		 692 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  60.99 
 
 		 697 aa  885    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  46.12 
 
 		 692 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  47.37 
 
 		 687 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  46.65 
 
 		 682 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  45.76 
 
 		 692 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  49.27 
 
 		 691 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  54.99 
 
 		 691 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  58.82 
 
 		 694 aa  861    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  44.66 
 
 		 692 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  44.2 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  44.96 
 
 		 691 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  44.26 
 
 		 692 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  46.74 
 
 		 695 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  44.49 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  44.26 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  44.22 
 
 		 697 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.14 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  44.36 
 
 		 692 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  44.28 
 
 		 673 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  45.43 
 
 		 670 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  45.4 
 
 		 690 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  43.68 
 
 		 692 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  43.24 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  44.85 
 
 		 691 aa  624  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  43.93 
 
 		 707 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.96 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  43.92 
 
 		 697 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  43.78 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  46.82 
 
 		 696 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  44.36 
 
 		 691 aa  621  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  43.23 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  43.63 
 
 		 697 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  44.46 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  43.62 
 
 		 701 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  43.85 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  43.85 
 
 		 699 aa  614  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  44.26 
 
 		 690 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  43.38 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  43.8 
 
 		 694 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  45.39 
 
 		 696 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  42.94 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  43.83 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  45.84 
 
 		 696 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  44.78 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  43.83 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  43.7 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  43.48 
 
 		 693 aa  611  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  45.1 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.14 
 
 		 696 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  43.51 
 
 		 689 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  45.69 
 
 		 673 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  43.38 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  44.74 
 
 		 688 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  43.38 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  44.28 
 
 		 691 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  43.72 
 
 		 688 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.12 
 
 		 700 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  43.5 
 
 		 695 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  44.59 
 
 		 688 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  42.46 
 
 		 693 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  43.67 
 
 		 698 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  43.35 
 
 		 704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  43.05 
 
 		 692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  43.48 
 
 		 667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  44.28 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>