More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1921 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  74.68 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  73.22 
 
 		 257 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  73.39 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  70.83 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  70.34 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  71.67 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  71.24 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  72.85 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  70.26 
 
 		 343 aa  345  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  70.26 
 
 		 314 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  66.12 
 
 		 304 aa  343  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  70.87 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  66.24 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  68.12 
 
 		 233 aa  338  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  64.68 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  66.81 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  63.28 
 
 		 252 aa  335  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  64.68 
 
 		 235 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  66.81 
 
 		 301 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  64.23 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  66.67 
 
 		 244 aa  331  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  64.94 
 
 		 232 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  63.2 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  65.94 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  65.07 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  64.32 
 
 		 248 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  62.34 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  58.14 
 
 		 291 aa  322  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  63.36 
 
 		 233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  63.36 
 
 		 233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  62.45 
 
 		 236 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  63 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  63.76 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  63 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  63.2 
 
 		 233 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  63.2 
 
 		 233 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 233 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.53 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  61.14 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  62.34 
 
 		 233 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  60.43 
 
 		 235 aa  315  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  60.16 
 
 		 289 aa  315  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 289 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  60.34 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  60.91 
 
 		 257 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  59.26 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  57.3 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 244 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  64.57 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  57.63 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0346  30S ribosomal protein S2  66.52 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  61.57 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 287 aa  308  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  61.02 
 
 		 283 aa  307  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  56.55 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  56.98 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  60.61 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  56.42 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  62.77 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  60.17 
 
 		 316 aa  304  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 		 279 aa  304  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  57.81 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 303 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  63.44 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  58.65 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  61.4 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  59.75 
 
 		 295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  62.93 
 
 		 255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  60.09 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  66.08 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  61.23 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  55.73 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2427  30S ribosomal protein S2  61.18 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  61 
 
 		 263 aa  298  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  62.95 
 
 		 271 aa  298  7e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  59.39 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  62.45 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1542  SSU ribosomal protein S2P  60 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  56.98 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  61.68 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  56.38 
 
 		 326 aa  295  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  57.81 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>