More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1920 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.78 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  54.67 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  51.31 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  50.65 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  51.95 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  50.33 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.69 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  49.84 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  49.17 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  46.25 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  50.83 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 312 aa  271  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  49.04 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  53.36 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  46.56 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  48.69 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  45.82 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  48.83 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  48.83 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  49.5 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  48.99 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  47.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  47.47 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  47.06 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.15 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  49.67 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  50.49 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  50.16 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  50.16 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  51.82 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  47.81 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  48.03 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  48.16 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.52 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  50.5 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  50.33 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 291 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.68 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.21 
 
 		 292 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  50.67 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  47.37 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  47.02 
 
 		 283 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.56 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  47.84 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  46.84 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.56 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  45.31 
 
 		 314 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.89 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.89 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  50 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  45.9 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  45.89 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 290 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  45.89 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  48.86 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44.86 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>