More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1893 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  59.18 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  64.86 
 
 
107 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  50 
 
 
106 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  62.5 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  61.25 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  67.11 
 
 
107 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  55.42 
 
 
106 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 
108 aa  95.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  61.33 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 
133 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  54.65 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  45.74 
 
 
117 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.46 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  44.68 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  42 
 
 
109 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  43.43 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 
96 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  45.36 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  46.46 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  42 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  51.35 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  54.32 
 
 
108 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
92 aa  87.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 
108 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  44.23 
 
 
121 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  57.33 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.42 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  54.93 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.56 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
120 aa  84.3  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.56 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  53.25 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  48.72 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  51.35 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  51.35 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  50.62 
 
 
105 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  43.75 
 
 
118 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
120 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  47 
 
 
108 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 
110 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  50.62 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  54.32 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  48.65 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  45.54 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  44.79 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  43.33 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  49.37 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  47.42 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  47.52 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  48.65 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  48.65 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  46.84 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  50 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  44.59 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  43.69 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  44.68 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  46.58 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  42.71 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  46.99 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>