More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1881 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.16 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  48.95 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.44 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.76 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.99 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.8 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.05 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  51.05 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  50.2 
 
 		 280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.49 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.49 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.73 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.43 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.11 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.15 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.26 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.85 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 		 366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  40.54 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.92 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  52.6 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.76 
 
 		 383 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.2 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.09 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.19 
 
 		 339 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 371 aa  195  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.63 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.69 
 
 		 348 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.02 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.02 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.35 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  47.29 
 
 		 269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  50.26 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  49.74 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.39 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  49.21 
 
 		 269 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.41 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.85 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  44.98 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.72 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  49.46 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  42.04 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.17 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.81 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.06 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  43.66 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  43.6 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  38.93 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  40.71 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  41.51 
 
 		 583 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.35 
 
 		 656 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.37 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.79 
 
 		 327 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  47.19 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  42.08 
 
 		 608 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.35 
 
 		 587 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.41 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  37.8 
 
 		 410 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.98 
 
 		 598 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.98 
 
 		 598 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.76 
 
 		 611 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  38.95 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.93 
 
 		 589 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.5 
 
 		 605 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.83 
 
 		 640 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.99 
 
 		 595 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.33 
 
 		 649 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.18 
 
 		 595 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.64 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.37 
 
 		 588 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  41.07 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.84 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.65 
 
 		 604 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.59 
 
 		 597 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  40 
 
 		 569 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.59 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.02 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  47.8 
 
 		 623 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.86 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.55 
 
 		 605 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.55 
 
 		 605 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.73 
 
 		 617 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.67 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  37.5 
 
 		 609 aa  152  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  43.3 
 
 		 601 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  35.09 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.02 
 
 		 561 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.5 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  38.6 
 
 		 609 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.67 
 
 		 831 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.29 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.29 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.51 
 
 		 563 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.9 
 
 		 566 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  42.5 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.63 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.21 
 
 		 613 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>