More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1848 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
275 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  53.41 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  48.65 
 
 
271 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 
276 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 
275 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  49.04 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  47.1 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  45.72 
 
 
288 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  46.82 
 
 
297 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  43.45 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  45.9 
 
 
284 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  45.9 
 
 
284 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 
270 aa  195  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  44.36 
 
 
263 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 
259 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 
268 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
272 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
269 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  46.36 
 
 
281 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  44.4 
 
 
278 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
269 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
285 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
285 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  42.54 
 
 
268 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  41.35 
 
 
271 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.61 
 
 
257 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  46.33 
 
 
281 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 
268 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  44.66 
 
 
269 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  40.52 
 
 
277 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
272 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  44.88 
 
 
267 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  43.18 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  43.41 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
272 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 
272 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
272 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
305 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 
285 aa  188  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  45.59 
 
 
281 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
287 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
278 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  42.8 
 
 
272 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  45.45 
 
 
284 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 
266 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  44.8 
 
 
252 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  41.22 
 
 
268 aa  185  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  42.41 
 
 
267 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  42.64 
 
 
278 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  42.42 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  42.02 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  41.98 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  41 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 
262 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
273 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 
285 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  43.02 
 
 
265 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
269 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  41.63 
 
 
272 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
268 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
268 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
301 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
273 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 
272 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
267 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 
297 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 
297 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  44.44 
 
 
284 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
268 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  42.08 
 
 
268 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
275 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
275 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
275 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
275 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
275 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>