30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1808 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  792  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  67.53 
 
 
391 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  65.72 
 
 
397 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  66.75 
 
 
391 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  64.45 
 
 
391 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  63.75 
 
 
404 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  60.05 
 
 
403 aa  492  1e-138  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  53.93 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  53.32 
 
 
404 aa  400  1e-110  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  50.13 
 
 
401 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  50.38 
 
 
405 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  48.48 
 
 
441 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  47.99 
 
 
395 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  47.84 
 
 
395 aa  352  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  36.22 
 
 
384 aa  234  2e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  34.46 
 
 
394 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  35.71 
 
 
387 aa  198  1e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  61.76 
 
 
145 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  31.62 
 
 
398 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  32.81 
 
 
413 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  29.16 
 
 
426 aa  130  5e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  33.09 
 
 
429 aa  129  9e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  55.88 
 
 
92 aa  79  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  25.19 
 
 
383 aa  74.3  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  23.41 
 
 
384 aa  71.2  3e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  24.93 
 
 
394 aa  64.7  3e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  30.91 
 
 
381 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.57228e-12  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  60.8  3e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  28.38 
 
 
408 aa  61.2  3e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  28.78 
 
 
412 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>