More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1739 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  43.39 
 
 
249 aa  188  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.96 
 
 
206 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.24 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  45.23 
 
 
204 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.43 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.44 
 
 
205 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  42.21 
 
 
222 aa  160  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  41.55 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.57 
 
 
213 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  45.23 
 
 
197 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.79 
 
 
212 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.65 
 
 
207 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.38 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  38.68 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  40.69 
 
 
204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  41.5 
 
 
205 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  41 
 
 
202 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.88 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  43.5 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  43.5 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  43.5 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  43.5 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  43.5 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  42.21 
 
 
201 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  39.32 
 
 
223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  39.32 
 
 
269 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  39.32 
 
 
269 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  39.32 
 
 
223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  39.32 
 
 
223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  40.8 
 
 
205 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  43.18 
 
 
198 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  39.32 
 
 
206 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  39.32 
 
 
206 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  39.32 
 
 
206 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.31 
 
 
199 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  39.32 
 
 
206 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  43.37 
 
 
209 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  38.35 
 
 
206 aa  141  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.21 
 
 
217 aa  141  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.27 
 
 
228 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  141  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.09 
 
 
229 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  39.71 
 
 
207 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.09 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  39.91 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.43 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.71 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  39.62 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  42 
 
 
202 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  42 
 
 
202 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.21 
 
 
200 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  42 
 
 
202 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  39.47 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  43 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  40.8 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  39.62 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  39.51 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  42.5 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.5 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.5 
 
 
203 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 
204 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  40 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  42.5 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  39.6 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.6 
 
 
206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  41.59 
 
 
218 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.57 
 
 
235 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  42 
 
 
203 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  40 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  40.19 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.42 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  40 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.2 
 
 
197 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  41.46 
 
 
205 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  40.98 
 
 
209 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.21 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  39.51 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.5 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  41.87 
 
 
233 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  39.6 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  40.2 
 
 
197 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  42.35 
 
 
207 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  41.5 
 
 
203 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  39.3 
 
 
205 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.46 
 
 
228 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  37.68 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  36.1 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.05 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  41.46 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  40.09 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>