More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1674 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  783  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.94 
 
 
391 aa  175  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.46 
 
 
394 aa  175  1e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  29.46 
 
 
398 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  28.76 
 
 
397 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28.91 
 
 
404 aa  165  1e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  28.5 
 
 
397 aa  163  5e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  30.2 
 
 
396 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  29.2 
 
 
434 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  28.27 
 
 
374 aa  153  6e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.72 
 
 
387 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  29.93 
 
 
416 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.59 
 
 
430 aa  148  1e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  28.76 
 
 
378 aa  147  2e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.85 
 
 
379 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  27.07 
 
 
428 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  28.18 
 
 
426 aa  140  5e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  30.08 
 
 
405 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  28.68 
 
 
382 aa  135  1e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  27.86 
 
 
428 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.89 
 
 
381 aa  135  2e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  26.93 
 
 
412 aa  132  1e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.29 
 
 
370 aa  132  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  26.92 
 
 
366 aa  132  1e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  27.03 
 
 
362 aa  131  2e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  27.42 
 
 
379 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  38.17 
 
 
372 aa  129  1e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  25.78 
 
 
377 aa  127  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  42.14 
 
 
438 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  41.51 
 
 
438 aa  127  4e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  25.98 
 
 
377 aa  127  4e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  25.98 
 
 
377 aa  127  4e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  28.37 
 
 
363 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  41.51 
 
 
438 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  37.1 
 
 
373 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  26.96 
 
 
440 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.88 
 
 
405 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  37.1 
 
 
372 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  27.15 
 
 
362 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  26.16 
 
 
441 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  25.99 
 
 
377 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  26.45 
 
 
379 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  25.89 
 
 
380 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.42 
 
 
398 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  25.89 
 
 
380 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  27.03 
 
 
362 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  27.03 
 
 
362 aa  122  1e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  28.93 
 
 
379 aa  120  5e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  25.85 
 
 
378 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  26.36 
 
 
375 aa  119  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  29.14 
 
 
369 aa  118  2e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  27.23 
 
 
420 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.14 
 
 
413 aa  117  4e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  40.25 
 
 
481 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  26.13 
 
 
394 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  25.41 
 
 
344 aa  115  1e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  26.25 
 
 
375 aa  115  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  26.04 
 
 
417 aa  115  1e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  29.1 
 
 
436 aa  114  4e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  28.57 
 
 
436 aa  114  4e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  22.68 
 
 
377 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  24.64 
 
 
377 aa  113  7e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  39.46 
 
 
477 aa  112  8e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  27.5 
 
 
382 aa  112  1e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25 
 
 
402 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.08 
 
 
374 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  25.8 
 
 
361 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  24.7 
 
 
411 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  41.35 
 
 
491 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  25.4 
 
 
382 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  37.13 
 
 
375 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  26.11 
 
 
377 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  29.02 
 
 
381 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.65 
 
 
387 aa  106  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  44.19 
 
 
411 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.66 
 
 
404 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  31.36 
 
 
373 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  27.03 
 
 
375 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  42.64 
 
 
432 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  26.21 
 
 
423 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  23.59 
 
 
379 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  27.08 
 
 
458 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  28.21 
 
 
369 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  25.87 
 
 
433 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  26.42 
 
 
433 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  25.87 
 
 
382 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25 
 
 
424 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  26.37 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  26.21 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  26.21 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  26.21 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  26.21 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  43.2 
 
 
541 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  26.21 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  26.21 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  26.21 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  26.21 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  26.21 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  24.82 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  24.82 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>