More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1609 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.94 
 
 		 714 aa  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.81 
 
 		 765 aa  855    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 717 aa  1466    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.93 
 
 		 772 aa  842    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.36 
 
 		 767 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.37 
 
 		 772 aa  837    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.08 
 
 		 829 aa  886    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.55 
 
 		 778 aa  848    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.66 
 
 		 904 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.03 
 
 		 772 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.32 
 
 		 819 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.18 
 
 		 819 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 683 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.1 
 
 		 904 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.75 
 
 		 908 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.39 
 
 		 818 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 		 681 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.03 
 
 		 842 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.52 
 
 		 700 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.39 
 
 		 740 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 685 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.65 
 
 		 817 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  41.45 
 
 		 818 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.87 
 
 		 827 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 832 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 		 862 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.05 
 
 		 818 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.72 
 
 		 822 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 753 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 		 842 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.1 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 		 786 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 779 aa  541  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.74 
 
 		 815 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.91 
 
 		 680 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 		 707 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 827 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.44 
 
 		 693 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 693 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 		 822 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 703 aa  530  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.09 
 
 		 694 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 		 693 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 702 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.6 
 
 		 706 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.24 
 
 		 689 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.41 
 
 		 691 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.78 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 679 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.48 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 685 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 		 776 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 781 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 690 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 695 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 773 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.27 
 
 		 686 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.92 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 693 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.62 
 
 		 692 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 693 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.28 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.86 
 
 		 693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  40.42 
 
 		 700 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.84 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.83 
 
 		 696 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.62 
 
 		 693 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 686 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 		 799 aa  512  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 		 706 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 691 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.49 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 		 696 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.62 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 		 787 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 693 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.71 
 
 		 818 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 		 696 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 719 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 693 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 693 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 693 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.76 
 
 		 693 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.68 
 
 		 691 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 815 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>