36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1603 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1603  NADP-reducing hydrogenase chain B  100 
 
 		 127 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1635  NADP-reducing hydrogenase chain B  78.74 
 
 		 127 aa  205  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000061136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1845  NADP-reducing hydrogenase chain B  75.59 
 
 		 127 aa  197  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3517  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  56 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0148  NADP-reducing hydrogenase chain B  42.52 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0994  ferredoxin-like protein  35.29 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  34.82 
 
 		 619 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  35.34 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0174  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  33.63 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  35.34 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3803  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  31.09 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2140  hypothetical protein  28.1 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0098  ferredoxin-like protein  29.41 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000332289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0918  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  32.26 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0340  ferredoxin  32.11 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000592647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  32.35 
 
 		 617 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1297  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 619 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2234  ferredoxin  33.94 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  26.55 
 
 		 562 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  31.97 
 
 		 640 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  26.96 
 
 		 571 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 604 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  28.57 
 
 		 640 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 		 580 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  27.87 
 
 		 641 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  26.53 
 
 		 590 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  28.57 
 
 		 624 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.44 
 
 		 620 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  23.71 
 
 		 562 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 		 562 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  23.77 
 
 		 623 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  32.93 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 		 604 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>