72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1570 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  283  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.13 
 
 
143 aa  192  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  67.38 
 
 
143 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  67.38 
 
 
143 aa  187  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  65.73 
 
 
143 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  64.34 
 
 
143 aa  184  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.12 
 
 
143 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  62.94 
 
 
143 aa  177  5e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14069e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  62.24 
 
 
143 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  61.54 
 
 
143 aa  173  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  59.57 
 
 
170 aa  169  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  58.74 
 
 
143 aa  168  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.74 
 
 
143 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  58.87 
 
 
143 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  55.63 
 
 
143 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.85 
 
 
143 aa  156  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  54.61 
 
 
143 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  54.61 
 
 
143 aa  149  9e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  50.35 
 
 
143 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  55.56 
 
 
143 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  53.85 
 
 
143 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  48.95 
 
 
143 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.24 
 
 
143 aa  139  1e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  45.71 
 
 
142 aa  139  2e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  48.94 
 
 
143 aa  136  9e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  45.07 
 
 
147 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.32 
 
 
147 aa  129  1e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.19299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.96 
 
 
147 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.96 
 
 
144 aa  125  2e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 
141 aa  125  2e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 
141 aa  124  4e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.26 
 
 
141 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.56 
 
 
141 aa  120  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  41.55 
 
 
151 aa  117  4e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  38.3 
 
 
145 aa  115  2e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  39.44 
 
 
151 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  39.86 
 
 
142 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  41.61 
 
 
149 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.28 
 
 
142 aa  110  8e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  40.56 
 
 
142 aa  108  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  42.45 
 
 
144 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  40.43 
 
 
145 aa  107  4e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  37.59 
 
 
142 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.16 
 
 
143 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.22 
 
 
145 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  36.36 
 
 
142 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  37.59 
 
 
142 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.11 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.84 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.35 
 
 
143 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  36.72 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  36.72 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  37.1 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  36.43 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  43.2 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  35.92 
 
 
142 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  41 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  40 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  31.88 
 
 
151 aa  82.8  2e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  39 
 
 
129 aa  82.4  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  37.14 
 
 
144 aa  73.6  8e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39 
 
 
129 aa  72.8  2e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.11 
 
 
153 aa  69.7  1e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  35.4 
 
 
137 aa  62  3e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29 
 
 
128 aa  47.4  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  28.28 
 
 
125 aa  47  9e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  27.48 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  23.31 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  38.64 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>