More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1552 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  52.47 
 
 
161 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  51.85 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  49.38 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  48.15 
 
 
159 aa  148  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  49.38 
 
 
159 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  46.54 
 
 
152 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  43.56 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  44.44 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  44.44 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  41.61 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  43.21 
 
 
153 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  42.33 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  43.83 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  45.57 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  42.33 
 
 
160 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  43.21 
 
 
154 aa  124  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  42.68 
 
 
161 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  41.72 
 
 
150 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  42.94 
 
 
150 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  47.14 
 
 
152 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  41.77 
 
 
159 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  43.31 
 
 
156 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  40.49 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.45 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  41.51 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  38.56 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  38.96 
 
 
151 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  41.1 
 
 
153 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  40.74 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.29 
 
 
150 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  41.07 
 
 
169 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  40.49 
 
 
153 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  42.58 
 
 
147 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  40.79 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.71 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.1 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.1 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.91 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  39.07 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  40.52 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  43.23 
 
 
151 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  36.67 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  39.75 
 
 
157 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  37.75 
 
 
154 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  37.8 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  39.49 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.25 
 
 
152 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.46 
 
 
169 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  41.38 
 
 
151 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  45.51 
 
 
181 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  42.22 
 
 
206 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.69 
 
 
151 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  37.27 
 
 
157 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  43.26 
 
 
151 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  44.14 
 
 
144 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.62 
 
 
153 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  40.91 
 
 
155 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  38.46 
 
 
173 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.66 
 
 
151 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  38.82 
 
 
158 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  36.65 
 
 
157 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  41.72 
 
 
151 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  39.61 
 
 
220 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  36.25 
 
 
154 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  36.25 
 
 
154 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  36.48 
 
 
150 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  36.48 
 
 
150 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  36.48 
 
 
150 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.11 
 
 
154 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.11 
 
 
154 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  38.62 
 
 
140 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  36.25 
 
 
156 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  38.16 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  37.13 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  36.88 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.22 
 
 
150 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  35.62 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.22 
 
 
154 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.22 
 
 
150 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  43.17 
 
 
150 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  36.25 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.22 
 
 
150 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>