108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1548 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  100 
 
 		 138 aa  289  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  32.06 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1224  DNA polymerase III chi subunit  30.15 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.009619  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  31.62 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  31.16 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  35 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  35.59 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  35.59 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  30 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  31.36 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  32.77 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  31.4 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  28.15 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  31.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  30 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.47 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  23.88 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  27.01 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  28.26 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  30 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  33 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  28.26 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  25 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  28 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  30.93 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.41 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  25.19 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.37 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  33.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.75 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  33.05 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  33.05 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  33.05 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.27 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.97 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  30.36 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.27 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  32.95 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.74 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  27.94 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1858  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.35 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2203  DNA polymerase III, chi subunit  28.35 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  25.9 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  27.54 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.03 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  22.07 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.41 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  23.91 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.41 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.66 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.66 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.66 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.41 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.66 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  28.77 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.15 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  29.27 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  22.79 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  28.87 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  29 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  29.17 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.31 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  28.93 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  24.26 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  25.18 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  25.18 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  24.67 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  24.64 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.44 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.6 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0561  DNA polymerase III subunit chi  31.53 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.87 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  23.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  24.64 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  25.38 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  25.38 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  25.35 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  24.62 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.81 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.45 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  26.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>