More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1538 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  47.17 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  37.21 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  35.9 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.07 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  34.54 
 
 		 356 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.23 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  34.84 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.6 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  38.86 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  33.71 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  32.65 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 298 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  31.71 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 387 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 379 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.92 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 376 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 205 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.15 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.73 
 
 		 373 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.9 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  29.09 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 378 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.87 
 
 		 377 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 378 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 431 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.14 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  32.42 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  28.21 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 378 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 387 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 391 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 386 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 428 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 379 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 379 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  28.42 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 		 351 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 192 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  24.08 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  28.06 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  30.53 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.53 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.53 
 
 		 386 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.04 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  30.53 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 508 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.53 
 
 		 386 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.31 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 417 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.91 
 
 		 333 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 392 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.27 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  30.09 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 912 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.17 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  28.94 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  27.51 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 492 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  29.92 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.57 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  37.07 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 919 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  26.49 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>