240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1512 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  52.09 
 
 		 902 aa  924    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  49.14 
 
 		 894 aa  867    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  100 
 
 		 906 aa  1873    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  51.29 
 
 		 899 aa  924    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.69 
 
 		 900 aa  834    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  49.37 
 
 		 894 aa  872    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.99 
 
 		 905 aa  808    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  49.1 
 
 		 898 aa  883    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.12 
 
 		 924 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.36 
 
 		 930 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.48 
 
 		 930 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  33.52 
 
 		 931 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 930 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  34.5 
 
 		 936 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  33.37 
 
 		 927 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  33.3 
 
 		 934 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.37 
 
 		 864 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  33.07 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  33.07 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  32.32 
 
 		 935 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  32.92 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  34.71 
 
 		 893 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 930 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  32.87 
 
 		 928 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  32.82 
 
 		 931 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  32.87 
 
 		 928 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 930 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 		 928 aa  436  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  31.78 
 
 		 936 aa  435  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  32.9 
 
 		 949 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  33.01 
 
 		 968 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  33.98 
 
 		 953 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  33.01 
 
 		 968 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  31.42 
 
 		 938 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  31.49 
 
 		 937 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  31.83 
 
 		 931 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 		 935 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 933 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  32.97 
 
 		 912 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  32.35 
 
 		 899 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.2 
 
 		 869 aa  425  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  31.93 
 
 		 914 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  32.18 
 
 		 936 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  32.67 
 
 		 941 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 933 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  32 
 
 		 1029 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  32.27 
 
 		 943 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  32.42 
 
 		 932 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  31.59 
 
 		 931 aa  416  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  31.46 
 
 		 941 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  30.86 
 
 		 912 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  31.12 
 
 		 925 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  31.84 
 
 		 969 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.92 
 
 		 937 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 989 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 889 aa  399  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.22 
 
 		 894 aa  396  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.83 
 
 		 887 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  30.69 
 
 		 899 aa  386  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  30.46 
 
 		 900 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  30.34 
 
 		 900 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.17 
 
 		 877 aa  376  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  30.5 
 
 		 899 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 897 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.23 
 
 		 892 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  29.33 
 
 		 900 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.04 
 
 		 936 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  34.77 
 
 		 862 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.77 
 
 		 862 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.12 
 
 		 916 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.14 
 
 		 893 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  29.73 
 
 		 900 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  29.73 
 
 		 900 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  29.73 
 
 		 900 aa  363  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  31.98 
 
 		 895 aa  363  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  29.61 
 
 		 900 aa  360  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  30.84 
 
 		 874 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  29.96 
 
 		 874 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  29.61 
 
 		 861 aa  358  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  29.61 
 
 		 861 aa  358  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  29.54 
 
 		 898 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  30.36 
 
 		 895 aa  354  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  30.08 
 
 		 852 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  29.93 
 
 		 891 aa  347  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  29.52 
 
 		 900 aa  346  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 881 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  29.02 
 
 		 881 aa  345  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  30.27 
 
 		 892 aa  344  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  29.94 
 
 		 898 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  30.25 
 
 		 858 aa  343  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  29.28 
 
 		 858 aa  342  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0485  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 864 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0747681  normal  0.0698071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  30 
 
 		 858 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  30.55 
 
 		 893 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  30 
 
 		 858 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  30.75 
 
 		 904 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.82 
 
 		 888 aa  341  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  30.71 
 
 		 884 aa  340  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  30.41 
 
 		 869 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  30.71 
 
 		 884 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>