More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1510 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
855 aa  671  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 
858 aa  665  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  4.11572e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 
857 aa  690  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  6.09956e-10 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
853 aa  664  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  43.27 
 
 
853 aa  666  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
851 aa  688  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  48.64 
 
 
882 aa  756  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
880 aa  692  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  47 
 
 
867 aa  816  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 
890 aa  730  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
851 aa  687  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 
859 aa  676  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 
932 aa  828  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
856 aa  697  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 
885 aa  643  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68418e-06 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 
855 aa  654  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
855 aa  672  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
855 aa  672  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
872 aa  697  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 
875 aa  729  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
878 aa  694  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 
863 aa  727  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  56.98 
 
 
872 aa  1010  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
871 aa  695  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  50.11 
 
 
869 aa  832  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
882 aa  639  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  43.27 
 
 
853 aa  666  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  48.84 
 
 
823 aa  752  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  40.87 
 
 
858 aa  637  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
928 aa  712  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 
881 aa  793  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 
859 aa  717  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  44.11 
 
 
857 aa  694  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 
872 aa  696  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  61.33 
 
 
872 aa  1090  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
862 aa  676  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
858 aa  684  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
855 aa  702  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
856 aa  694  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
853 aa  678  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  48.74 
 
 
868 aa  837  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
855 aa  682  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
939 aa  657  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
939 aa  656  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 
891 aa  650  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 
881 aa  722  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 
872 aa  696  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
851 aa  689  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 
859 aa  680  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
860 aa  665  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  43.27 
 
 
853 aa  666  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
853 aa  679  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 
871 aa  676  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 
903 aa  653  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
851 aa  688  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 
858 aa  682  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
895 aa  734  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
856 aa  698  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 
855 aa  685  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
883 aa  698  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 
856 aa  695  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  45.55 
 
 
854 aa  696  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 
854 aa  686  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  46.57 
 
 
903 aa  774  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.4 
 
 
865 aa  763  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 
896 aa  693  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.16 
 
 
897 aa  762  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
872 aa  672  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 
868 aa  660  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 
860 aa  704  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 
888 aa  709  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
865 aa  645  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 
868 aa  724  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  44.99 
 
 
864 aa  729  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  60.5 
 
 
869 aa  1061  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  47.48 
 
 
880 aa  753  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
853 aa  680  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
869 aa  695  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 
894 aa  663  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 
891 aa  750  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 
828 aa  653  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
897 aa  643  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 
893 aa  644  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 
886 aa  716  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  43.92 
 
 
858 aa  705  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.35 
 
 
862 aa  722  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  44.96 
 
 
930 aa  639  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 
868 aa  749  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
848 aa  692  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  49.49 
 
 
898 aa  762  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
854 aa  679  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 
852 aa  685  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  43.27 
 
 
853 aa  666  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 
910 aa  697  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  44.89 
 
 
885 aa  716  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  45.31 
 
 
888 aa  710  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
890 aa  726  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
856 aa  697  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 
853 aa  744  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
892 aa  727  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>