More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1490 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  52.61 
 
 		 831 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  48.73 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  44.15 
 
 		 489 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  47.23 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  51.87 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.84 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  46.67 
 
 		 684 aa  209  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  48.33 
 
 		 557 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.05 
 
 		 528 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1402 aa  202  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  42.97 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  46.22 
 
 		 789 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1493 aa  193  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  47.62 
 
 		 256 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.59 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.72 
 
 		 235 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.39 
 
 		 961 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.53 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.97 
 
 		 376 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.97 
 
 		 376 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  43.39 
 
 		 685 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  42.91 
 
 		 416 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  46.72 
 
 		 1877 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  44.8 
 
 		 2413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  41.74 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.54 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.28 
 
 		 838 aa  172  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.83 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  39.22 
 
 		 373 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1002 aa  169  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.47 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.61 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.43 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  42.54 
 
 		 490 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  43.81 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  42.11 
 
 		 490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  41.03 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.55 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  49.05 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.79 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.85 
 
 		 839 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  42.34 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.95 
 
 		 232 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.66 
 
 		 255 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.4 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 1032 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.2 
 
 		 976 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.47 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.93 
 
 		 1037 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  37.26 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.06 
 
 		 509 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.6 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  37.82 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.3 
 
 		 282 aa  149  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.97 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  35.69 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.16 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.76 
 
 		 509 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  30.13 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.57 
 
 		 185 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  38.4 
 
 		 509 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 464 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.32 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.55 
 
 		 399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.82 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  42.93 
 
 		 731 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  39.82 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1430 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  43.18 
 
 		 208 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 865 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.5 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.7 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 		 523 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  43 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  42.51 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  47.31 
 
 		 193 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  42.51 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  35.59 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  35.44 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  35.59 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.12 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.98 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.39 
 
 		 552 aa  129  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  41.55 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  41.78 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  44.77 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.76 
 
 		 679 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  38.7 
 
 		 839 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  36.61 
 
 		 680 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.37 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38.79 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.73 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.72 
 
 		 798 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  36.14 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  42.44 
 
 		 850 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  40.83 
 
 		 172 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>