More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1463 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  100 
 
 		 352 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  51.31 
 
 		 347 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  38.55 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  50 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.53 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.07 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.32 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.42 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.42 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.42 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.45 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.32 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.45 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.32 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.32 
 
 		 391 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.45 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.67 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.91 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.72 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.62 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.03 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.56 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.02 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.03 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.03 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.03 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.03 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.68 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.3 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  29.02 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 426 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  31.01 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  29.39 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.92 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.32 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  26.26 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 358 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.33 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.7 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.7 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.35 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.35 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.35 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.79 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.79 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.79 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.7 
 
 		 422 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.79 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.44 
 
 		 429 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>