More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1424 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  79.35 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  77.17 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  77.17 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  73.12 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  69.89 
 
 		 99 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  75.56 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  72.04 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  75.56 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  71.11 
 
 		 113 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  71.11 
 
 		 113 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  71.11 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  69.23 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  57.78 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  49.44 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  48.91 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  48.39 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  49.46 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  47.78 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  46.15 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  47.83 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  47.83 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  48.35 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  50.56 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  47.83 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  46.07 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 98 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 99 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  46.74 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  48.31 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2591  integration host factor, alpha subunit  47.25 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.3815  normal  0.0354419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  46.15 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 99 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  50.57 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2014  integration host factor subunit alpha  46.67 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0886978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  48.84 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2093  integration host factor subunit alpha  46.67 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 98 aa  95.9  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  47.19 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>