More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1419 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  62.24 
 
 		 165 aa  191  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  60.84 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  61.38 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  61.97 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  58.87 
 
 		 202 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  56.94 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  56.55 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  57.75 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  54.55 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  56.16 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  53.47 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  55.86 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.25 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 		 192 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  54.86 
 
 		 154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.43 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  52.78 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 		 219 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  51.03 
 
 		 238 aa  170  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 180 aa  170  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 194 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  53.79 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 225 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 190 aa  169  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 194 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  52.08 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 194 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 177 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  53.79 
 
 		 166 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  53.79 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  55.17 
 
 		 179 aa  167  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  53.79 
 
 		 174 aa  167  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  54.48 
 
 		 173 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  56.39 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  53.79 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  54.23 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  57.89 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52.11 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  54.17 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  51.39 
 
 		 205 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  54.48 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  53.47 
 
 		 184 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  50.69 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  54.93 
 
 		 182 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 174 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  53.15 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  49.3 
 
 		 207 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  56.94 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  51.72 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 156 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  51.03 
 
 		 225 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  51.03 
 
 		 178 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 227 aa  163  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  53.47 
 
 		 177 aa  163  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  52.08 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.03 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  52.08 
 
 		 196 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  51.02 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  49.3 
 
 		 174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  52.11 
 
 		 222 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  52.45 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  56.55 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  53.15 
 
 		 173 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  57.24 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  55.86 
 
 		 177 aa  161  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  51.03 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  49.31 
 
 		 182 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 175 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>