More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1405 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  56.23 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 		 298 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 		 300 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  53.04 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 		 297 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 301 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  53.64 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 303 aa  308  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  48.8 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  48.8 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  50.65 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  50.16 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  50.16 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  51.02 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  50.33 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 303 aa  295  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 294 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 301 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  46.64 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  47.2 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  46.1 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  45.21 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 		 297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  43.03 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  46.56 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 299 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  45.71 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  46.44 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 320 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.94 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.47 
 
 		 451 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  41.37 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 		 318 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>