More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1403 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  51.34 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  46.7 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  44.89 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  46.4 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  48.68 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  43.93 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  43.95 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  44.59 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  45.13 
 
 		 377 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.99 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  45.67 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.16 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.47 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.12 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.34 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  46.83 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  42.01 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.89 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.63 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.79 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  43.96 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.89 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.61 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  46.23 
 
 		 282 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.08 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.86 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  41.44 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  41.78 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  46.57 
 
 		 383 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.69 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  46.57 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.73 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.46 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  42.15 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.92 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.94 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  43.13 
 
 		 385 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  43.05 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  41.59 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.83 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.83 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  42.41 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  42.41 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  40.83 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.13 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.51 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.23 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  41.55 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  40.47 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.54 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.35 
 
 		 240 aa  167  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  45.45 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.27 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  45.95 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  42.15 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40.89 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.43 
 
 		 253 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  39.82 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  45.5 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  41.85 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.44 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  40.91 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  40.91 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  44.55 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  42.93 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  40.28 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.46 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  45.07 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  38.81 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  43.69 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43.2 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  43.33 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  43.81 
 
 		 276 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  42.86 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  42.16 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  40.27 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  41.83 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.22 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  38.67 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  46.4 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  40.53 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  40.44 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  40.44 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>