More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1396 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  100 
 
 
322 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.38 
 
 
306 aa  268  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  42.76 
 
 
310 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  47.19 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  43.05 
 
 
306 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.72 
 
 
305 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.11 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.76 
 
 
310 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.25 
 
 
318 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  43.61 
 
 
306 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  40.4 
 
 
298 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.18 
 
 
310 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.3 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.86 
 
 
316 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  42.39 
 
 
307 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.54 
 
 
316 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.98 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.06 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  43.8 
 
 
309 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  42.75 
 
 
302 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.79 
 
 
310 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  38.56 
 
 
348 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  44.44 
 
 
314 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  40.74 
 
 
320 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  41.33 
 
 
315 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.69 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  41.41 
 
 
297 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  40 
 
 
318 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.71 
 
 
299 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.78 
 
 
303 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.43 
 
 
304 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.97 
 
 
298 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.72 
 
 
298 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.79 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  41.91 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.05 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  39.48 
 
 
307 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  36.97 
 
 
258 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  39.78 
 
 
299 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.77 
 
 
260 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.28 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  38.28 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.63 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  37.95 
 
 
308 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  35.74 
 
 
263 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  37.95 
 
 
308 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  37.95 
 
 
299 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  37.95 
 
 
299 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.16 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  34.78 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.78 
 
 
292 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.85 
 
 
299 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.43 
 
 
299 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  37.62 
 
 
299 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  38.85 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.85 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.49 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  37.29 
 
 
299 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.1 
 
 
273 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
292 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
292 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  34.11 
 
 
292 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
292 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  34.98 
 
 
299 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
292 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
279 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 
292 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  31.94 
 
 
292 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  31.61 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31 
 
 
247 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.68 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.13 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  39.13 
 
 
246 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  36.92 
 
 
246 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.54 
 
 
246 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  38.43 
 
 
246 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.31 
 
 
255 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.87 
 
 
246 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.87 
 
 
246 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.87 
 
 
246 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  37.69 
 
 
245 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.54 
 
 
246 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.11 
 
 
246 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.53 
 
 
246 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.11 
 
 
246 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.11 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.11 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  38.79 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.11 
 
 
246 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 
245 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  31.74 
 
 
243 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  34.72 
 
 
215 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  40.45 
 
 
246 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.51 
 
 
243 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.57 
 
 
246 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.08 
 
 
249 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.4 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.4 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.4 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.33 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>