More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1333 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  62.8 
 
 		 251 aa  324  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.24 
 
 		 654 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  53.63 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 257 aa  279  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  54.22 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  54.44 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  57.66 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  57.66 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.94 
 
 		 655 aa  268  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  54.43 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  54.85 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51.63 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  52.74 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.03 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  51.9 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 646 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.39 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 650 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>