More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1322 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  70.11 
 
 		 531 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  67.35 
 
 		 533 aa  755    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  68.61 
 
 		 531 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  67.35 
 
 		 533 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1101    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  69.92 
 
 		 531 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  58.21 
 
 		 541 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  67.67 
 
 		 534 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  68.8 
 
 		 531 aa  770    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  58.29 
 
 		 535 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  58.29 
 
 		 535 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  57.71 
 
 		 535 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  56.64 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  57.03 
 
 		 532 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  56.4 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  56.08 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  56.75 
 
 		 538 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  56.75 
 
 		 538 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  54.17 
 
 		 539 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  57.33 
 
 		 535 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  54.61 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  56.21 
 
 		 533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  54.1 
 
 		 555 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  56.08 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  56.82 
 
 		 534 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  56.7 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  55.56 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  55.13 
 
 		 536 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  56.01 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  56.53 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  55.73 
 
 		 528 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  57 
 
 		 532 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  53.03 
 
 		 531 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  56.73 
 
 		 533 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  56.81 
 
 		 532 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  54.67 
 
 		 537 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  54.86 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  53.47 
 
 		 550 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  56.53 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  54.77 
 
 		 537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  54.6 
 
 		 537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  55.64 
 
 		 541 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  54.6 
 
 		 537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  54.6 
 
 		 537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  54.98 
 
 		 537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  54.61 
 
 		 538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  54.86 
 
 		 537 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  54.41 
 
 		 537 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  55.25 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  55.06 
 
 		 529 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  54.43 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  53.18 
 
 		 539 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  51.98 
 
 		 531 aa  558  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  55.64 
 
 		 533 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  55.17 
 
 		 537 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  54.72 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  54.05 
 
 		 534 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  54.32 
 
 		 538 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  55.06 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  52.44 
 
 		 539 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  54.05 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  54.44 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  54.49 
 
 		 538 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  54.51 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  54.51 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  55.97 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  53.42 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  53.02 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  53.63 
 
 		 536 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  51.89 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  54.01 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  55.86 
 
 		 528 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  51.7 
 
 		 531 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  53.99 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  56.58 
 
 		 529 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 		 532 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 		 538 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  54.02 
 
 		 538 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  55.45 
 
 		 528 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  53.18 
 
 		 543 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  55.13 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  52.59 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  55.27 
 
 		 528 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  55.25 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  51.7 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  52.42 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  54.32 
 
 		 544 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  55.17 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  55.25 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  52.42 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  53.03 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>