68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1319 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  36.11 
 
 
143 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  36.81 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  34.72 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.72 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  36.36 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.21 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  35.42 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.52 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  36.11 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.64 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.88 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  34.72 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14069e-13 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.21 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  35.92 
 
 
143 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.09 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  36.21 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  35.42 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  31.25 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  34.03 
 
 
143 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  33.1 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.41 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.56 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.56 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  34.03 
 
 
143 aa  82  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  33.07 
 
 
144 aa  82.8  2e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.39 
 
 
143 aa  82.4  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  32.39 
 
 
143 aa  81.3  4e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  31.43 
 
 
145 aa  80.9  6e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  30.56 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  38.79 
 
 
143 aa  80.5  8e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.65 
 
 
147 aa  80.1  9e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.19299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  79.3  2e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  34.78 
 
 
145 aa  78.6  3e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.4 
 
 
135 aa  77.8  5e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.64 
 
 
143 aa  76.6  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.72 
 
 
147 aa  73.9  6e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  29.86 
 
 
142 aa  73.2  1e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  30.28 
 
 
142 aa  72.8  2e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  27.34 
 
 
142 aa  72  2e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.28 
 
 
142 aa  71.6  3e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  28.06 
 
 
142 aa  72  3e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  29.66 
 
 
147 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  29.66 
 
 
147 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.21 
 
 
145 aa  68.6  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  68.6  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  28.68 
 
 
129 aa  67.8  5e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  28.68 
 
 
129 aa  67  9e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  27.91 
 
 
129 aa  66.6  1e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  29.79 
 
 
142 aa  65.9  2e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  32.04 
 
 
151 aa  64.3  6e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  26.67 
 
 
144 aa  62.4  2e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  28.28 
 
 
147 aa  62  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  35.35 
 
 
129 aa  61.2  4e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.75 
 
 
129 aa  60.5  7e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  34.34 
 
 
129 aa  60.1  1e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  34.34 
 
 
129 aa  59.7  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  27.4 
 
 
149 aa  58.9  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  33.91 
 
 
137 aa  56.6  1e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  27.86 
 
 
151 aa  56.6  1e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.39 
 
 
153 aa  47.8  5e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  21.05 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>