More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1267 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  100 
 
 
300 aa  620  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.68 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.68 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.68 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
327 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
327 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.42 
 
 
327 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
344 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.56 
 
 
326 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
326 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.7 
 
 
326 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.53 
 
 
1157 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
317 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
1035 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  31.84 
 
 
334 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.56 
 
 
326 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.43 
 
 
334 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
310 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.38 
 
 
351 aa  102  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
330 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  45.05 
 
 
312 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
313 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
302 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  28.47 
 
 
311 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  34.92 
 
 
341 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  28.78 
 
 
353 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 
329 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
324 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 
295 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
342 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
321 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  37.14 
 
 
343 aa  99.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  29.86 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1032 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.06 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
341 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  30.29 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 
348 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
358 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
321 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32.64 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  44.25 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
376 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  47 
 
 
1177 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  38.53 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  47 
 
 
1177 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
348 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
320 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  45 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  37.82 
 
 
215 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  26.19 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 
324 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
773 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
209 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  45.22 
 
 
345 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
1032 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  30 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
374 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.93 
 
 
637 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  26.92 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  46.88 
 
 
1169 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  37.5 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
689 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.81 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
597 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  31.22 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.7 
 
 
336 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
329 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
351 aa  89.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.1 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>