More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1250 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  100 
 
 
227 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  60.18 
 
 
230 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  60.27 
 
 
224 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 
225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  55.86 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  56.62 
 
 
224 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  55.45 
 
 
223 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  56.11 
 
 
227 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  59.81 
 
 
275 aa  245  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50.91 
 
 
233 aa  241  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.91 
 
 
233 aa  241  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  50.91 
 
 
233 aa  241  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
233 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
233 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 
234 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
233 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
233 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
233 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
233 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
227 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.12 
 
 
236 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
235 aa  235  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
235 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 
238 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.81 
 
 
238 aa  232  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
225 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  53.39 
 
 
225 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  51.87 
 
 
242 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.09 
 
 
233 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 
234 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 
234 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  51.12 
 
 
230 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  49.77 
 
 
223 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.86 
 
 
234 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50 
 
 
229 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  55 
 
 
224 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  53.37 
 
 
224 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.56 
 
 
227 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.82 
 
 
225 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
231 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  50.23 
 
 
231 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  50.23 
 
 
231 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.8 
 
 
233 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
253 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
253 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
236 aa  224  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.17 
 
 
239 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.4 
 
 
230 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.39 
 
 
231 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  52.51 
 
 
232 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
227 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  50 
 
 
227 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  50.47 
 
 
227 aa  221  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.14 
 
 
242 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.14 
 
 
242 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50.91 
 
 
244 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
235 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.85 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 
225 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  53.14 
 
 
222 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  49.55 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.11 
 
 
227 aa  218  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
231 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
231 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
231 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
231 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
227 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.77 
 
 
238 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.08 
 
 
249 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.47 
 
 
233 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
232 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.77 
 
 
235 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.58 
 
 
237 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  50.23 
 
 
226 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.08 
 
 
249 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
240 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
240 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.11 
 
 
249 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
249 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.61 
 
 
225 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
252 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  48.85 
 
 
235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.08 
 
 
249 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>