More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1247 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 326 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  65.59 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  63.8 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  63.5 
 
 		 340 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  62.69 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  60.24 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  56.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  56.52 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  54.52 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  59.63 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.85 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  55.8 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  54.97 
 
 		 365 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  57.94 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  55.9 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  57.68 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  56.21 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  59.22 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  55.28 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  57.1 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.94 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  57.99 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  54.66 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  57.37 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  57.37 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  55.28 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  54.13 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  57.37 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  57.19 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  53.7 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  54.97 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  54.94 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  53.87 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  54.21 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  53.56 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  55.49 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  56.72 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  56.86 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  55.17 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  55.17 
 
 		 376 aa  364  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.7 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  58.03 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  53.11 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  54.46 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.56 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  54.83 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  53.75 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  57.05 
 
 		 391 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  54.01 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  56.74 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  56.6 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  56.11 
 
 		 375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  56.74 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  56.74 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 371 aa  361  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  55.38 
 
 		 331 aa  361  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  54.97 
 
 		 330 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  56.92 
 
 		 352 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  53.73 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  56.39 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  56.43 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  53.65 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>