248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1245 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  100 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  30.25 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  29.8 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  29.87 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  29.8 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  29.8 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  29.8 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  29.8 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  29.8 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  29.8 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  29.8 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  29.47 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  27.87 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.55 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  28.87 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  28.87 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  28.87 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  28.87 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  31.96 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  28.87 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.23 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  28.37 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0050  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.49 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.71429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.88 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  29.93 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  29.93 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  26.28 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  31.02 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.58 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.45 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  28.27 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  29.5 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.82 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  27.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  27.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  27.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  27.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.67 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  27.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  27.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.82 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  28.33 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  25.29 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  26.3 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.47 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1714  hypothetical protein  28.08 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100165  hitchhiker  0.0002003 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  25.25 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.9 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.42 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  25.34 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25.28 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  29.29 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.38 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  27.05 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  26.94 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  29.61 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  24.1 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.99 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.43 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.18 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  24.32 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.43 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  24.43 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  24.43 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>