More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1235 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  56.79 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  57.4 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  53.79 
 
 
287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  53.41 
 
 
287 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  50.19 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  61.5 
 
 
250 aa  274  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  48.18 
 
 
276 aa  258  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  48.19 
 
 
284 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  48.03 
 
 
420 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  46.54 
 
 
434 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 
483 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  45.38 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  41.57 
 
 
434 aa  208  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  39.43 
 
 
285 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 
452 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  41.34 
 
 
273 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  44.44 
 
 
425 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  46.09 
 
 
273 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  44.4 
 
 
421 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
435 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  42.28 
 
 
442 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  40.14 
 
 
425 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  40.32 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  38.4 
 
 
434 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 
464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 
464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  39.63 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  41.15 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  38.87 
 
 
414 aa  195  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  38.08 
 
 
442 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  38.25 
 
 
311 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  38.76 
 
 
295 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  39.92 
 
 
461 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  42.4 
 
 
537 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 
439 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  39.52 
 
 
420 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  41.6 
 
 
435 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  37.85 
 
 
311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  38.71 
 
 
433 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  37.73 
 
 
432 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  37.85 
 
 
298 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  42.75 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  38.1 
 
 
422 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38 
 
 
295 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  40.08 
 
 
443 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  37.05 
 
 
295 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  38 
 
 
286 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
403 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  35.41 
 
 
445 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  35.41 
 
 
445 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  36.65 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  36.65 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.6 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  39.13 
 
 
293 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  36.65 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  37.81 
 
 
291 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  37.45 
 
 
295 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.81 
 
 
291 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  36.73 
 
 
291 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  36.73 
 
 
291 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
438 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.59 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  38.3 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  37.11 
 
 
437 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  42.04 
 
 
440 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  37.4 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  38.49 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  38.08 
 
 
487 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  37.4 
 
 
309 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.1 
 
 
279 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  35.16 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  35.48 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.1 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  41.06 
 
 
457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  37.59 
 
 
490 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  36.08 
 
 
281 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  38.49 
 
 
291 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
424 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  41.99 
 
 
484 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  39.36 
 
 
436 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  39.36 
 
 
436 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  39.36 
 
 
436 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>